Motherwell lo dejó tarde para completar un regreso en casa a Peterhead mientras Lukas Fadinger miraba con un encabezado ordenado en 91 minutos.
Jack Brown había atrapado a la defensa de Fir Park para atacar para los visitantes de la Liga Uno, mientras que Emmanuel Longelo rompió un ecualizador en la esquina superior.
Motherwell luchó por largos períodos contra una defensa cargada, pero un excelente cruce de Callum Slattery sacó a Fadinger fuera de la marca de su nuevo club.
Morton encabeza la sección en seis puntos después de una victoria en casa por 3-0 sobre Stenhousemuir.
Solo unas horas después de que el equipo de Greenock anunció un nuevo contrato para Tomi Adeloye, el delantero anotó dos veces, con Owen Moffat agarrando el otro gol para el equipo de Dougie Imrie.
